拿著從死去的蓮身上得來的蝙福卡,真司變成了夜骑·Survive，駕著暗影朝向核心镜前進。然而此刻的他，是應該要將核心镜給擊破，讓騎士間的戰鬥停止；還是要繼承蓮的心願，替他完成騎士的戰鬥（讓惠理甦醒），面對這樣兩難的問題，真司要如何抉擇呢？

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「這是另一個的龍騎的故事！」

「另一個的開端的故事！」

「這個故事準備了兩種的結局！」

「是要城戶真司繼承秋山蓮的遺願，繼續戰鬥呢？」

「還是就此替戰鬥畫上休止符呢？」

「決定的權力就在你們手上！」

「你們每一人的選擇都將決定這個故事的結局！」

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ORE JOURNAL的新進社員---城戶真司，在採訪新聞的途中，意外的因為鏡世界的怪物---レスパイダー的緣故，被捲進了另一個世界：「鏡世界」。而當怪物襲擊他時，神秘的戰士---龍騎出現了。

雖然龍騎解救了真司的危機，然而在レスパイダー及隨後從核心镜中，誕生的ミスパイダー合攻下，龍騎立刻陷入了苦戰。雖然在「昇龍突破」的攻擊下，將レスパイダー給擊破了，可是龍騎卻也因力竭而倒下了…

看著龍騎倒地，而去察看狀況的真司，卻發現自己的身體正要分解！？察覺到此事的龍騎（神原耕一），恢復成人身的狀態，告訴他：「除非變成騎士，否則普通人是不可能再離開鏡世界了」後，將炎龙卡交給了真司，希望他能變身和怪物戰鬥。還沒來得及搞清楚狀況的真司，拿著從神原處接來的炎龙卡，變身成為龍騎，一擊將剩餘的ミスパイダー給擊破了。不過在交代真司將ミスパイダー給擊破，同時將寫有13名騎士資料的名單交與真司後，神原耕一也因生存的時限截止而消失了。

回到現實世界的真司，遇上了想向他索回炎龙卡的一對男女：秋山蓮及神崎優衣。在蓮的告知下：

「成為騎士的人，都有著自己想達成的目標。」

「為了讓自己的願望實現，騎士將戰鬥至最後一人」

真司雖然對成為騎士抱著些許的不安，但還是希望能夠繼承耕一的心願：『摧毀-「核心镜」』。而由於「核心镜」是由眾多的怪獸守護著，貿然的想僅以一人之力，幾乎是不可能達成這個目的。於是真司決定尋找能一起完成這個目標的伙伴。

按照神原耕一所給予的13人騎士的名單，真司找上了目前人正身陷牢獄的假面騎士王蛇·淺倉 威。而在見到淺倉威的同時，亦遇上了同為假面騎士的律師·北岡秀一。北岡利用監禁淺倉的同時，奪走了他的毒蛇卡，然而沒想到淺倉利用真司安全帽上的鏡面，不單是成功召來ベノスネーカー，順利奪回毒蛇卡，更趁機變身成王蛇，順利從監獄中脫逃出來。

雖然和淺倉及北岡的接觸不是那麼順利，不過真司仍是繼續的尋找志同道合的伙伴。下一個目標便是高見澤集團的總裁·高見澤逸郎。然而高見澤卻十分熱衷於騎士戰爭：

「現在的世界也就像騎士戰爭一樣」

「為了生存下去，就必須將其他人給踢下」

「所有人其實都是騎士啊！」

非但不願加以協力，並且也萌生了要先將真司這個異端者抹殺的念頭。

接下來找到的人物是手塚海之。手塚因為對於「騎士非得要犧牲其他人的生命，才能完成自己的心願」一事感到疑惑，雖然有意願，但卻拒絕了和蓮一起作戰。原來手塚和惠里也曾是戀人的關係，蓮及手塚成為騎士的目的，都是為了給予惠里新的生命。

隨著公園傳出女性遭到鏡世界怪物的襲擊，龍騎、赤鳐及夜骑三人進入鏡世界和其作戰。而當三人正在鏡世界合作與怪物們戰鬥的同時，由高見澤所變身的假面騎士·变色龙卻悄悄地出現在他們的身後，準備解決這些「不合群」的騎士們。首當其衝的便是赤鳐！在和赤鳐的戰鬥中，先是遭「复制降临」利用模仿的夜骑一劍刺穿身體後，再被其「最终降临」最給一擊打倒。

真司繼續向名單上的下一人：芝浦純進行遊說。然而芝浦將其視作有趣的遊戲，斷然拒絕了真司的提議。隔天，真司尋訪另一位騎士：須藤雅史，總算是獲得了須藤的同意。然而同時間，高見澤卻和芝浦、北岡一起來到「花雞」，遊說蓮加入他們來共同剷除真司。雖然因為手塚之事，使蓮對高見澤有所不滿，但因不想被視為真司般「天真的傢伙」，蓮答應了高見澤的要求。

感應到怪獸出現的真司及須藤，一同變身為龍騎及西扎斯進入鏡世界戰鬥。面對強力的怪獸，龍騎取出了『Survive卡「烈火」』，再變身為龍騎，以流星射击一擊將怪物解決。然而戰勝的喜悅並未維持多久，因為緊接下來的，竟然是索鲁达、变色龙、凯及夜骑四人的圍剿，而先前一同協力對付怪物的西扎斯，竟然也倒戈相向，對龍騎展開無情的攻擊。

原來須藤因為沈迷於騎士強大的力量，為了「成為騎士的最強者」而選擇背叛龍騎。只是當西扎斯正準備消滅龍騎時，出來解救龍騎的，竟然是---王蛇！就因為對須藤警察身份的厭惡，王蛇毫不留情的對西扎斯展開攻擊，在王蛇「最终降临」的攻擊下，即使西扎斯瞬間取出盾牌来來防禦，依舊是逃不了被消滅的命運。在消滅了西扎斯緊接著就是索鲁达與王蛇間的戰鬥。而被变色龙、凯及夜骑三人圍攻的龍騎，終於是不支倒地了。

為了證明夜骑的決心变色龙要求夜妻對龍騎進行最後一擊。然而夜骑猶豫了許久，終究是無法對龍騎下手。

於是变色龙也將夜骑列為和龍騎一樣的軟弱傢伙，準備將兩人一起收拾…不過由於變身的時限將近索鲁达、变色龙、凯也只好先行撤退。

逃過一劫的真司和蓮，為了躲避其他人的獵捕，四處的躲藏著。對於無法給龍騎最後一擊而自我厭惡的蓮，雖然真司以「我們是同伴，騎士戰爭真的是件很愚蠢的事情，讓我們一起結束它吧！」但是蓮卻無法答應「我有一個無論如何都想要幫助的人啊。為了如此，我一定要在這場戰鬥中勝利！」

被芝浦發現的兩人，再次被眾人所包圍的兩人，難道無計可施了嗎？原本真司想制止要變身的蓮，但在蓮「我不想輸給自己的軟弱！」之言下夜骑和龍騎先後進入了鏡世界。

進入鏡世界的夜骑和龍騎，立刻被包括变色龙、凯、索鲁达、王蛇、奥丁、白鸟、大牙、铃羊、龙牙等九位騎士聯合攻擊。然而在這些騎士混戰的同時，夜骑也出現了。為了替龍騎作掩護，夜骑幫龍騎接了变色龙的「最终降临」之攻擊。雖然身受重傷，但也立刻反擊，使出「最终降临」「疾風斬」將变色龙給擊破。只是擊破变色龙后也因力竭而變回了蓮…

而另一方面，遭到圍攻的龍騎，在被奥定摧毀炎龙卡後，也變回了真司。正當兩人均陷入危機之時，守護核心镜的;的怪獸們開始對騎士們展開攻擊了。趁著混亂之時，真司趕緊衝往蓮的身旁，察看蓮的情況。知道自己以無力再戰的蓮，將自己的蝙福卡交給了真司：

「我們…不是同伴嗎？」

「城戶…代替我戰鬥吧！」

「惠里就拜託你了。」

在交予真司蝙福卡後，蓮便進入了永遠的沈默……

原本想趁機殺害蓮及真司的凯，因為未注意到ミスパイダー的出現，而慘被其吞食。不過雖然又減少了一名騎士，殘存的騎士們仍舊是緊逼著真司而來

藉由蓮的蝙福卡，真司變身成為夜骑·Survive，駕著暗影突破了騎士們的包圍，朝向核心镜前進。然而此刻的他，內心卻是十分的矛盾：

「只要擊破那面鏡子，全部就都會結束了！」

「但是這樣真的好嗎？」

「我究竟該如何是好呢？」

隨著以「最终降临」「飛翔斷」擊破阻於前方的ミスパイダー後，真司在核心镜之前停下，回身面對著緊追而來的騎士們：

「我要代替蓮戰鬥！」

「蓮，你應該也不知該如何作選擇吧。」

「你為了找出解答，所以才會一直戰鬥吧。」

「我也要戰鬥。為了找出你所尋求的解答！」

隨著眾騎士紛紛開始使用準備用「最终降临」展開攻擊，夜骑·Survive也取出了劍，勇敢的朝向眾人突進。

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「這樣的結局，是因為你們的選擇而決定的。」

「然而，這樣真的就好了嗎？」

「答案，會在另一個的龍騎的故事中揭曉吧？」

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